检察院在刑事诉讼的审查逮捕和审查起诉阶段，可以依法对公安机关和本院侦查部门在侦查活动中的各项证据进行审查。在此过程中，犯罪嫌疑人和辩护律师有可能提出排除非法证据的申请。根据申请的各种情况，检察院会有不同的处理方式。
在犯罪嫌疑人申请排非的情况下检察院的处理方式主要有以下4种：
1、人民检察院应当调查核实；犯罪嫌疑人及其辩护人申请排除非法证据，并提供相关线索或者材料的。
2、人民检察院要全面审查案件事实、证据；犯罪嫌疑人申请排除非法证据，但未提交相关线索或者材料的。其中在审查逮捕阶段未发现侦查人员存在以非法方法收集证据的情形，认为符合逮捕条件的，可以批准逮捕。
3、来不及落实的可在批捕后继续对可能存在的非法取证行为进行调查核实；审查逮捕期限届满前，经审查无法确定存在非法取证的行为，但也不能排除非法取证可能的，该证据不作为批准逮捕的依据。检察官应当根据在案的其他证据认定案件事实和决定是否逮捕，但在作出批准或者不批准逮捕的决定后， 应继续落实。
4、发现和核实后符合条件的要排除非法证据。无论在哪个阶段，发现侦查人员确有以刑讯逼供等非法方法收集证据的，应当依法排除相关证据并提出纠正意见。
检察院在刑事诉讼过程中，在犯罪嫌疑人和辩护律师提出来排除非法证据的申请后，应该根据是否提供了相应的线索和证据确定是落实线索还是全案审查，对于存疑的证据暂时不得使用，在期限内应该继续对有关非法证据问题进行落实。无论在何种阶段，发现和落实了非法证据的时候都要进行排除。排除非法证据后，犯罪嫌疑人不再符合逮捕条件但案件需要继续审查起诉的，应当及时变更强制措施。案件不符合起诉条件的，应当作出不起诉决定。这些强制性的规定从本质上都是为了保护犯罪嫌疑人的权利！
